LE PROFILE DE L’EPIDÈMIE

Nous vivons à une époque intéressante!
Les pandémies sont l’étoffe des romans de science-fiction et des films à succès; pourtant ils sont bien réels! Les générations qui subissent la pandémie de COVID-19 marqueront la chronologie de leur vie par cet événement mondial, tout comme les générations précédentes ont utilisé des guerres majeures ou des ralentissements économiques comme points de référence temporels – des repères historiques qui ouvrent et définissent les récits de leur vie. Une caractéristique particulièrement intéressante de cet événement est que la gestion des données, les outils de communication et la culture et l’infrastructure de la santé publique sont à tous les niveaux.

Les historiens disséqueront les leçons humaines et sociétales qui émergent depuis des décennies.
De plus, la science a progressé à un rythme effréné depuis l’épidémie du virus du SRAS Corona en 2003.
Par exemple, en 2003, nous venions de terminer le projet du génome humain. Il s’agissait d’une collaboration mondiale impliquant plusieurs universités, gouvernements et entreprises privées. Il a fallu 13 ans pour terminer au coût de 2,7 milliards de dollars américains (en équivalents de l’exercice 1991). Aujourd’hui, nous pouvons séquencer la séquence génique d’un patient en une journée pour environ 1 000 $.
Il est facile d’extrapoler ce que cela signifie pour la recherche scientifique. Quelques mois seulement après le début de cette pandémie, nous commençons déjà à voir la machinerie scientifique se mettre en marche. Les coronavirus sont courants et sont étudiés depuis des décennies. Une recherche PubMed de coronavirus effectuée à la mi-mars 2020 montre que nous produisons des publications scientifiques sur ce sujet à 10 fois le rythme de la décennie précédente – et nous ne faisons que commencer. Il est possible qu’à la fin de l’année, nous en ayons appris plus sur cette espèce particulière de coronavirus que sur tous les virus du 20e siècle réunis. Cela ressemble à une hyperbole et n’est pas vraiment vérifiable, mais le fait est que l’accélération de l’accumulation de connaissances est exponentielle.
Cette nouvelle est particulièrement encourageante car les avantages de la recherche sont chaotiques et imprévisibles. Bien que nous ayons vraisemblablement fait un énorme bond en avant dans la prévention et le traitement de ce virus en quelques années, il est encore plus sûr qu’il y aura des découvertes de grande envergure et imprévues en cours de route. De cette façon, la recherche sur les coronavirus est en fait un «tir de lune» forcé – un objectif audacieux et ambitieux qui motive les équipes, les gouvernements et la population à réaliser ce qui était auparavant jugé impossible. La mission Apollo est un exemple palpable récent: à un coût approximatif de 25 milliards de dollars, elle a capturé l’imagination de l’imagination du public du monde entier alors que l’humanité faisait ses premiers pas sur la planète. Il a également apporté des avantages innombrables et imprévisibles, certains banals tels que les «Tang» et les bâtonnets spatiaux (ceux-ci peuvent en fait être des légendes urbaines), certains de réels avantages pratiques (comme la vulgarisation du Velcro – désolé de décevoir, mais la NASA n’a pas non plus inventé cela). soit), et certains qui ont changé le cours des industries et des technologies entières comme le développement de logiciels et du circuit intégré (le précurseur des puces électroniques). Alors que le coût total du programme Apollo était d’environ 25 milliards de dollars (153 milliards en dollars de 2018 – un montant vraiment astronomique), il est généralement reconnu que le retour sur investissement de ce projet a été très gratifiant en raison des retombées industrielles que la NASA les technologies développées ont donné lieu à. Mis en perspective, il s’agit d’une petite fraction des 2 billions de dollars budgétisés pour le plan de relance financier américain COVID-19.
Mis à part les avantages futurs de la recherche, le besoin urgent de recherches sur la prévention et le traitement du COVID-19 est lié à la nature explosive des épidémies, à l’ampleur de l’épidémie et à sa portée mondiale. Il est indéniable que le nombre total de patients infectés à l’heure actuelle est inférieur à celui du SRAS et du MERS. Il faut aussi reconnaître que c’est beaucoup moins pour l’instant que les taux habituels de grippe. Par exemple, le CDC estime que nous pourrions avoir environ 50 millions de cas de grippe aux États-Unis au cours de la saison 2019-2020. Près de la moitié d’entre eux iront chercher des soins médicaux, environ 1% seront hospitalisés et 1 sur 1000 mourra. C’est quelque chose comme 50 000 morts – pas de petites pommes de terre et plus à ce jour que pour le virus responsable du COVID-19 dans le monde. Le problème avec COVID-19 est que le taux de mortalité est beaucoup plus élevé. Cette situation, combinée au nombre de patients gravement malades, accable de nombreux systèmes de soins de santé, et les coûts financiers, psychologiques et humains de cette situation sont extrêmement élevés.
Les graphiques ci-dessous représentent la progression du COVID-19 à travers le monde depuis le premier cas en Chine le 31 décembre 2019.

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* Sauf indication contraire, les articles de blog sur ce site sont écrits par moi, le fondateur et médecin en chef de CASH – The Coalition for the Acquisition of Sound Habits (identifié dans la signature comme Northerndoc). Je suis interniste général praticien travaillant comme consultant dans plusieurs disciplines de la GI dans un hôpital de soins secondaires du nord du Québec depuis plus de 25 ans. J’ai également terminé un congé sabbatique à mi-carrière en étudiant les interventions nutritionnelles à l’Université d’Oslo et j’ai par la suite terminé une maîtrise en santé publique. Dans la mesure du possible, je ferai référence à des experts scientifiques et fournirai des références en matière de science, et je reconnaîtrai et explorerai clairement l’incertitude et les conséquences involontaires potentielles de toute intervention en santé publique. Les opinions exprimées sont le résultat de discussions avec des collègues et le conseil d’administration de CASH, mais sont finalement mes spéculations et mon opinion personnelles. c’est-à-dire uniquement à titre d’information et ne doit pas être interprété comme un avis médical direct. Ce qu’il faut faire dans une situation spécifique variera au fil du temps et dépend dans une large mesure des problèmes locaux. Veuillez consulter les fournisseurs de soins de santé locaux de confiance au besoin.

PROFILE OF THE EPIDEMIC

We live in interesting times!
Pandemics are the stuff of science fiction novels and blockbuster films; yet they are very real! The generations that endure the COVID-19 pandemic will mark the chronology of their lives by this global event, much as previous generations used major wars or economic downturns as temporal reference points – historical landmarks that pave and define the narratives of their lives. A particularly interesting feature of this event is that data management, communication tools, and public health culture and infrastructure are at all time highs.

Historians will be dissecting the human and societal lessons that emerge for decades.

Moreover, science has advanced at breakneck rates since the SARS Corona virus epidemic of 2003.
For example in 2003, we had just completed the Human Genome Project. This was a worldwide collaboration involving multiple universities, governments, and private companies. It took 13 years to complete at a cost of 2,7 Billion US dollars (at fiscal year 1991 equivalents). Today we can sequence a patient’s entire gene sequence in about a day for roughly $1,000.

Its easy to extrapolate what this means for scientific research. Just a few months into this pandemic we are already starting to see the scientific machinery cranking into gear. Coronaviruses are a common and have been studied for decades. A PubMed search for coronavirus done mid march 2020 shows that we are producing scientific publications on this topic at 10 times the rate of the previous decade – and we are just getting started. It is possible that by the end of the year we will have learned more about this particular species of coronavirus than we  learned about all viruses in the 20th century combined. That sounds like hyperbole, and is not really verifiable, but the point stands that the acceleration of knowledge accumulation is exponential.

This is particularly encouraging news because benefits of research are chaotic and unpredictable. While we are likely to have taken a huge leap in the prevention and treatment of this virus in a few short years, it is even more sure that there will be far reaching and unpredicted discoveries along the way. In this way, coronavirus research is in effect a forced “moonshot”  – an audicious and aspirational goal that motivates teams, governments, and the population to achieve what was previously felt to be impossible. The Apollo mission is a recent palpable example: at a rough cost of $25 Billion, it captured the imagination of the imagination of the public around the world as mankind took their first steps off the planet. It also brought uncountable and unpredictable benefits some banal such as “Tang” and space food sticks (those may actually be urban legends), some of real practical benefit (like the popularization of Velcro – sorry to disappoint, but NASA also did NOT invent this either), and some that changed the course of industries and whole technologies like the development of software and the integrated circuit (the forunner to microchips). While the total cost of the Apollo program was around 25 Billion dollars (153 Billion in 2018 dollars – a truly astronomical amount), it is generally recognized that the return on investment from this project has been highly rewarding because of the spin off industries that NASA developed technoligies gave rise to. Put into perspective, this is a small fraction of the $2 TRILLION budgeted for the US COVID-19 financial stimulus package.

Future benefits of research aside, the pressing need for research into the prevention and treatment of COVID-19 relate to its explosive nature of outbreaks, the magnitude of the epidemic,  and its global reach. There is no denying that the total numbers of infected patients at this time dwarf that of SARS and MERS. We must also acknowledge that this is a lot less for now than the usual rates for influenza. For example the CDC estimates that we could have about 50 Million cases of flu in the US in the 2019 – 2020 season. About half of them will seek medical care, about 1% will be hospitalized and 1 in 1000 will die. Thats something like 50, 000 deaths – no small potatoes and more to date than we have for the virus causing COVID-19 across the world. The problem with COVID-19 is that the mortality rate is much higher. This combined with the numbers of acutely ill patients is overwhelming many health care systems, and the financial, psychological and human costs of this are heartbreakingly high.

The graphics below represent the progression of the COVID-19 across the world since the first case in China on December 31, 2019.
These are simple graphs, drawn directly fron WHO data, on a linear scale with updates once weekly. This is the right scale and time to help us understand and react to this pandemic as any collective action to flatten the curve of the infection will take minimally a week or two to have any effect. Focussing on hourly or daily progress is great for news cycles. For the population, the proper focus is on what we can to today in terms of good “Pandemic Hygeine” to slow the rate of infection and keep all of us safer.

If may not feel like your efforts at prevent the spread are too small to measure but that is patently false for several reasons:

1. A asymptomatic infected person (and many people – especially young people are asymptomatic), who is socially active can spread the infection to dozens in a single day. And these infected people will likely be spreading the virus before they have any symptoms, and
2. Taking yourself out of the chain of transmission puts a drop of water on the firestorm that is brewing. That seems pointless, but remember that there are millions of us. Together, our millions of drops can snuff out this infection – we know this by looking at the data in countries like China, South Korea, and Japan where governments and the population demonstrated incredible focus, discipline, and collaboration towards the prevention of viral spread.

Most countries are at the beginning of their upswing in infections and the numbers are worrisome.
Nobody expects them to flatline over a week, but there is great hope that our collective actions can help bend the curve and take pressure of the health care system. While we all get to the task of slowing down this infection and caring for each other, we invite all readers to follow our graphs as we collectively break the momentum of the virus and bend the line downward. Graphs are updated once weekly each Monday (after the release of Sundays data).

Thanks to all of you for your interest, your attention, and your thoughtful contributions to the cause.

BE PRUDENT-STAY INFORMED-PRACTICE PANDEMIQUE HYGEINE-TAKE CARE OF EACH OTHER

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* Unless otherwise specified, blogposts on this site are written by me, the founder and physician in chief of CASH – The Coalition for the Acquisition of Sound Habits (identified in the byline as Northerndoc). I am a practicing General Internist working as a consultant across multiple IM disciplines in a secondary care hospital of northern Québec for more than 25 years. I also completed a mid career sabbatical studying nutrition interventions at the Unversity of Oslo and subsequently completed a masters in public health. As much as possible, I will refer to scientific experts and provide references in matters of science, and will clearly acknowledge and explore  the uncertainty and potential unintended consequences involved with any public health intervention. The opinions expressed are a result of discussions with colleagues and the board of CASH, but ultimately are my personal speculation and opinion. ie for information purposes only and not to be construed as direct medical advice. What to do  in any specific situation will vary over time and depends to a great extent on local issues. Please consult trusted local health care providers as needed.